Med preiskovanjem drugega primera je junak igre Mystery Subway Escape 2, detektiv Michael, našel skrivni vhod v zapuščene postaje podzemne železnice. Malo ljudi ve zanje. Ne govorimo o tehničnih predorih, temveč o postajah, ki so nekoč delovale, a so se iz takšnih ali drugačnih razlogov izkazale za zaprte in nezahtevane. Ostalo je nekaj opreme, stvari in predmetov, ki jih niso zavrgli, ker bi lahko bili še uporabni. Tam bo naš junak iskal dokaze in nato izhod, saj je vrata, kamor je vstopil, nekdo zaklenil v igri Mystery Subway Escape 2. Očitno so ga opazovali in se odločili, da se znebijo natančnega detektiva.