Zoper skupino teroristov je bil ustanovljen poseben oddelek, ki jih mora uničiti. Na podlagi vašega ukaza vzemite pet najboljših borcev, ki jih lahko ustvarite sami, ter razdelite značilnosti in razrede med njimi. Kampanja igre Strike Force Heroes 2 z goljufijami nadaljuje logičen zaključek prvega dela, vendar če uporabljate goljufanje, se bo igra preoblikovala in igranje bo postalo veliko bolj zanimivo.