Igra AtomLinker je lahko kratka ali pa traja v nedogled. Vse je odvisno od vaše pozornosti in spretnosti. Igralno polje je napolnjeno s kvadratki z imeni kemijskih elementov. Povežite jih v verige treh ali več enakih. Sprva boste prejeli petindvajset sekund časa za igranje, če pa lahko sestavite verige štirih ali več elementov, bo čas dodan. Ne umaknite pogleda z igralnega polja, da ne zamudite naslednje verige. Po odstranitvi elementov se bo postavitev ploščic spremenila v AtomLinkerju.