Na vesoljski ladji Nautilus so sistemi nizke ravni nepričakovano odpovedali. Računalniki prikazujejo rdeč signal za pomoč in se ne odzivajo na ukaze v Nautilus Spaceship Escape. Nujno je treba nekaj narediti. Glavno vozlišče se nahaja na mostu in če v normalnih pogojih zlahka pridete do njega, potem ko je sistem neuravnotežen, so nekateri predelki zaprti in nimate kartice s ključem. Najprej raziščite razpoložljive predelke in zberite vse, kar potrebujete za reševanje trenutnih nalog, nato pa glavnega v Nautilus Spaceship Escape.