Izjava, da več kot je možganov, pametnejši je človek, je napačna, vendar junak igre Braininess 2 temu ne verjame in želi zbrati čim več možganov. Prepričan je, da bo po tem postal zelo pameten. Ni ga treba razočarati, le pomagajte junaku dokončati nalogo. Na vsaki stopnji morate lika voditi po belih ploščicah, zbirati možgane in se ustaviti pri zadnji rumeni ploščici. Predpogoj za dokončanje stopnje je zbiranje vseh možganov. Ne pozabite, da ko stopite na ploščico, bo ta izginila, zato vrnitve ni več. Načrtujte svojo pot, da ne boste delali napak v igri Braininess 2.