Ninja se je dolgo učil in končno je prišel čas, da uporabi svoje znanje in veščine v Dark Ninja Hanjo. Sensei je svojega učenca obvestil, da je pripravljen začeti samostojno življenje, hkrati pa je bil nekdanji učenec pozvan, da opravi zelo pomembno nalogo obnoviti mesto. Misija bo pokazala, kako pripravljen je junak. Mesto je požrlo temo; osvoboditi se boste morali z demoni ali obsedenimi bojevniki. Ninja bo lahko pokazal, česa je sposoben. Prejemajte navodila od učitelja; on bo spremljal svojega učenca, potem pa morate ukrepati sami v Dark Ninja Hanjo.
