Junak igre Final Ninja se ima za zadnjega ninjo svoje vrste. Sovražnemu klanu je uspelo iztrebiti vse junakove sorodnike, vendar se ne bo vdal. Tudi če mora umreti, namerava s seboj vzeti vse sovražnike. Medtem morate najti brlog sovražnikov in za to boste morali premagati številne ovire. Za premikanje uporabite puščice in s klikom na gumb miške vrzite šurikene. Če med metanjem držite tipko, lahko zgrabite in se povlečete na višje platforme, na katere v Final Ninji ne morete skočiti.
