Zdi se, da za ninje v Flip Ninji ni gravitacije. Lahko skoči in nato pade z enako okretnostjo, vedno trdno stoji na obeh nogah. Zato mu samo skakanje ni problem, kar pa bo v vesolju, bo postalo preizkušnja. Z leve in desne letijo ostri šurikeni in drugi prebadajoči in rezalni predmeti. Izbrati morate trenutek, ko je pot prosta in šele nato skočiti. Za vsak uspešen skok boste prejeli eno točko, in če vam uspe zgrabiti sadež: rdeč ali zelen, boste v Flip Ninja prejeli tri točke naenkrat.