Vojska stranišč Skibidi je vdrla v mesto in zdaj se nobeden od prebivalcev ne more počutiti varnega. So izjemno okrutni in agresivni, vendar ima človeštvo kar nekaj takih sovražnikov. Veliko bolj grozno je dejstvo, da so sposobni spremeniti ljudi v svoje vrste in nenehno povečevati njihovo število. Da bi to preprečili v igri Skibidi Toilets: Infection, so se mestne oblasti odločile, da ne bodo spustile ljudi na ulice, niti vojakov, ker so ogroženi. Namesto njih so bili povabljeni Snemalci, saj imajo imuniteto pred učinki pošasti in bogate izkušnje v boju z njimi. Vi boste nadzorovali enega od teh posebnih agentov. Vzemite orožje in začnite prečesavati ulice mesta. Bodite pozorni na situacijo okoli sebe, saj se stranišča Skibidi lahko pojavijo iz katere koli smeri in morate biti pripravljeni. Takoj ko najdete sovražnika, ga ujemite v daljnogled in začnite streljati. Za vsako uničeno pošast boste prejeli točke, ki jih lahko uporabite za dopolnitev streliva in izboljšanje orožja. Vsak nivo bo imel določeno število stranišč Skibidi. Vse jih morate odstraniti, da napredujete na naslednjo stopnjo v igri Skibidi Toilets: Infection.