Tudi najmočnejši bojevnik se enkrat sreča s še močnejšim in potem mora pobegniti in to ni strahopetnost, ampak začasen umik, da bi zbral moči in se maščeval. V igri Run Ninja Run boste pomagali junaku, ki je bil poražen v dvoboju z zelo močnim nasprotnikom. Zmagovalec je zvezal ujetnika in sedel počivat ter razmišljati, kaj bo z njim naprej. In medtem ko je razmišljal, je našemu junaku uspelo pobegniti. Zdaj je vse odvisno od njegove spretnosti in vaše spretnosti. Junak ima dovolj moči za hiter tek, vi pa ga boste v igri Run Ninja Run prisilili, da skoči, se stisne v ozka mesta in uniči skakalne ograje.
