Za zapletene in odgovorne naloge, ko je nemogoče ustvarjati nepotreben hrup, so imenovani agenti s posebnimi znanji in sposobnostmi. Tak v igri Stealth Master 3D je naš junak. Poskuša ne uporabljati osebnega orožja, ampak upravlja s sabljami, noži, meči, da bi deloval tiho, ne da bi pritegnil pozornost. Pred vsako stopnjo boste prejeli nalogo in jo morate opraviti, da dobite novo. Zastopnik te ravni se ne bi smel zmotiti. Pritihotapite se v sobo, se približajte neznanemu sovražniku in udarite. Če se obrne in je vaš junak v območju rdečega žarka, misija v Stealth Master 3D ne bo uspela.
