Ninja se je odločil, da pretegne noge in teče po mestu in zbira kovance. V igri Ninja Runner boste srečali junaka in mu pomagali urediti mestni parkour. Za junaka ni nepremostljivih višin, lahko večkrat kliknete na fanta in skočil bo na kateri koli vrh: ploščad, stolp in še en vrh. Ko pretečete raven, se lahko premaknete na drugo, vendar bodite previdni, na novih ravneh bodo dodatne ovire v obliki ostrih konic, na katere vam ni treba skočiti, da ne izgubite življenjskih src. Vse več je ostrih ovir, kar pomeni, da boste morali biti zelo hitri in spretni, da rešite ninjo pred izgubo življenj v Ninja Runnerju.
