Voda ali katera koli druga tekočina bo po gravitacijskih zakonih stekla navzdol, če bo sama našla izhod, četudi majhna razpoka. V Water Flow 3D ga morate pustiti, da prosto teče, da napolnite kvadratne posode spodaj. Število posod se bo razlikovalo, vendar ne pozabite, da lahko vanje vlijete samo tekočino ustrezne barve. Če želite to narediti, odprite lopute v pravilnem vrstnem redu. Včasih bo treba mešati tekočine, steklene predelne stene pa razbiti s težkimi kroglami v Water Flow 3D. Stopenj je veliko in so raznolike pri postavljanju nalog.
