Spider-Man se včasih, še posebej v zadnjem času, dogajajo nenavadne stvari. Lahko gre spat v svojo hišo in se zbudi na povsem drugem mestu. To je nekakšna čarovnija ali super tehnologija, to morate ugotoviti, preden se poslabša. V igri Marvel Ultimate Spider-man Mystery City se boste skupaj s super junakom znašli v skrivnostnem mestu, ki ga ni na zemljevidu. Najverjetneje je v vzporednem vesolju. Spider-Man želi razumeti, kako se prevaža v vesolju in zakaj ravno tukaj. Za premikanje po mestu. Treba je skočiti in pristati točno na modrih ploščicah, sicer se lahko junak poškoduje v skrivnostnem mestu Marvel Ultimate Spider-man.
