Pogumni samuraj po imenu Kyoto živi v svetu pikslov. Danes mora naš junak potovati v oddaljena območja svoje države in se tam boriti z različnimi kriminalci. Pri tem mu boste pomagali vi v igri Pixel Samurai. Vaši samuraji bodo vidni na zaslonu pred vami, ki se nahaja na določenem območju. S kontrolnimi tipkami ga boste spustili naprej. Pozorno si oglejte zaslon. Na poti vašega junaka se bodo pojavile različne vrste ovir in lukenj v tleh. Ko je vaš lik na določeni razdalji od tega nevarnega območja, ga boste morali prisiliti, da skoči. Tako bo vaš junak letel po zraku skozi to nevarnost in bo lahko nadaljeval svojo pot.
