Pogumen ninja bojevnik po imenu Kjoto se je pridružil tajni diviziji svoje države. Njegova naloga je odpraviti šefe mafije. Danes mu v igri Stealth Master 3D pomagate pri opravljanju različnih nalog. Pred seboj na zaslonu boste videli svojega lika, ki je v sobi stavbe z orožjem v rokah. Oboroženi stražarji bodo hodili po tleh. S krmilnimi tipkami boste upravljali dejanja svojega lika. To boste morali storiti, da se bo prikradel sovražniku in nato udaril s svojim mečem. Tako boste sovražnika ubili in zanj dobili točke. Vaša naloga je, da na ta način očistite celo nadstropje pred stražarji in ubijete šefa.
