Pogumni ninja Kyoto je od vodje svojega ukaza dobil nalogo, da prodre na varovano posestvo aristokrata in od tam ukrade tajne dokumente. Vi v igri Endless Ninja mu boste pomagali dokončati to nalogo. Vaš lik se bo premikal po cesti, ki postopoma pridobiva na hitrosti. Na svoji poti bodo naleteli na različne vrste pasti. Vaš junak, ki se jim približuje, bo moral pod vašim vodstvom narediti skoke. Tako bo po teh nevarnih odsekih ceste letel po zraku. Včasih boste naleteli na različne vrste predmetov in kovancev, raztresenih povsod. Vse jih boste morali poskusiti zbrati.
