V daljni prihodnosti so znanstveniki razvili posebno miniaturno ladjo, s katero je bilo mogoče uničiti različne vrste virusov. Vi v igri Virus Hunter jo boste nadzirali. Preden boste na zaslonu videli človeško telo, znotraj katerega se nahaja ta enota. Letel bo naprej in postopoma pridobival hitrost. Na njeni poti bodo nastale različne bakterije. Natančno boste morali streljati iz posebnih orodij, da boste padli v te bakterije in jih tako uničili.
