Nori profesor Thomas ponovno izvaja poskuse v svojem tajnem laboratoriju. Neuspešen poskus mešanja različnih kemikalij je povzročil eksplozijo in v zraku so se pojavile kroglice, napolnjene s strupenim plinom. Postopoma napolnijo sobo. Vi v igri Profesor Bubble Shooter boste morali znanstveniku pomagati, da se jih znebi. Za to bo naš junak uporabil poseben top, ki bo izstrelil enojne naboje. Poiskati boste morali gručo mehurčkov iste barve in skozi njih sprostiti naboj popolnoma iste barve. Tako jih boste uničili in dobili točke.