Predstavljajte si, da je običajni svinčnik začel živeti in zdaj poskuša poznati svet okoli njega. Naš lik se je odločil, da gremo po apartmaju in ti v igri Pen Run mu bo pomagal s tem. Vaš junak se bo moral premakniti po črtkani črti, ki bo vidna pred vami. Pot bo imela veliko preobratov in zavojev. S krmilnimi tipkami boste morali strogo držati svinčnik. Ob istem času boste na poti naleteli na različne ovire, ki jih boste morali izogniti. Ne pozabite, da bo vsako trčenje povzročilo izgubo in smrt vašega junaka.
