V igri Jump Box Ninja, bomo prišli v svet, kjer živijo ljudje v škatli. Tudi v tem svetu obstaja kasta Ninja bojevnikov, se bomo seznanili z enim od njih. Ta bojevnik bo danes prešel v smrtonosne ovire, da postane mojster borilnih veščin. Videli boste svojega junaka na zaslonu. Z različnih strani bo izstrelil ostre sile, ki bodo v trenutku udarili v svoj lik, samo ubiti. Moral boste spretno uganiti trenutek in dobiti znak, da skoči. Tako bo letel čez nevarno ozemlje in nadaljeval.
