Pogumen ninja Kyoto mora vstopiti v zaščiteni grad in ukrasti od tam enega artefakta, ki je nekoč ukradel tempelj svojega naročila. V igri Jump Ninja Hero se pridružite njegovim pustolovščinam. Da bi prišli do gradu, mora naš junak teči skozi določeno območje, ki ga varujejo sovražni vojaki. Z našim junakom se bo nenehno izstrelil od lokov, razbojnikov in drugega orožja. Vozite naš junak, ki bo moral uničiti vse leteče predmete. Samo tako lahko preživi in doseže končno točko svojega potovanja.
