V sodobne Japonske v tajnem reda skrivnostni ninja bojevnik še vedno obstaja. Nekatere od teh vojakov celo naročil za usmrtitev zločincev, ki imajo visoke položaje v vladi. Danes v Gun Ninja igri bomo igrati za tak plačanec. Je prejel naročilo za umor, in zdaj se je treba, da se v zaščitenem posestvu. Spretno skozi svojih hodnikih, skakanje čez vrzeli v tleh in se izognili pastem, bomo korak naprej. Imamo seveda vojaki bodo napad zaščito, vendar smo z uporabo strelnega orožja, ki jih bo vse ubil. Glavna stvar, da ne pustite jim priti blizu vas, ker potem lahko imaš poškoduje svoje meče in vaš lik se bo ubil. Vendar pa lahko na poti za zbiranje komplet prve pomoči, ki bi bi svoj življenjski standard.
